På Mekane Yesus-Seminaret kan teologistudenter velge å fordype seg i Christian Muslim Relation (CMR) dvs. relasjonen mellom kristne og muslimer. Her lærer studentene mer om islam, historie, likheter og ulikheter med kristen tro. Formålet er å utruste kirkens fremtidige prester og ledere på to nivåer. For det første ønsker man å utruste kirken til å være lys og salt i verden, det vil si at man ønsker å formidle evangeliet både i ord og handling.
For det andre vil man utruste kirkens prester og ledere til å være pådrivere for fredelig sameksistens og gjensidig forståelse mellom kristne og muslimer i de ulike lokal samfunn de er en del av. Dette er i tråd med myndighetenes ønske å styrke fredelig sameksistens mellom de religiøse grupperingene i landet. Det er sannsynlig at de som studerer ved Mekane Yesus-Seminaret vil utruste andre ledere og frivillige i kirken på synodenivå (tilsvarende bispedømme), sokn og lokal menighets nivå. Denne kompetansen er også etterspurt ved de regionale seminarene. NMS sin støtte går til ressurser knyttet til undervisning og til stipend. Ved å støtte dette prosjektet er du med på å bidra til å bedre relasjonen mellom kristne og muslimer, og å øke kirkens bevissthet om hvordan man kan formidle evangeliet på en god måte, preget av respekt og godvilje for sin neste, både i ord og handling.